农村合作医疗异地办理医疗报销的流程是：
1、在住院前或住院后3日内打老家新农合咨询电话对住院就医情况进行登记备案；
2、出院后必须在居住所在地由街道办事处或居委会出具一份居住证明，如果是在外务工，需有务工单位出具务工证明；
3、出院后持相关资料到参合所在地报销；具体资料如下；
（1）病历复印件；
（2）汇总明细单；
（3）住院收费票据；
（4）出院证明；
（5）患者身份证；
（6）合作医疗证及居住或务工证明。
4、如果是从参合所在地直接到省外住院化疗，必须在走之前办理转诊转院手续，然后才可去外地住院治疗；
5、省外报销的比例最低，一般起付线2000左右，报销比例为合理费用的45%，医院级别越低，报销比例越高。
法律依据：《中华人民共和国社会保险法》第二十八条
符合基本医疗保险药品目录、诊疗项目、医疗服务设施标准以及急诊、抢救的医疗费用，按照国家规定从基本医疗保险基金中支付。
第二十九条
参保人员医疗费用中应当由基本医疗保险基金支付的部分，由社会保险经办机构与医疗机构、药品经营单位直接结算。
社会保险行政部门和卫生行政部门应当建立异地就医医疗费用结算制度，方便参保人员享受基本医疗保险待遇。
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