法律分析：有影响，需要走一定的手续流程。离开深圳后，公司就会给你办理停保手续，办好后，公司所在地的社保局经办机构给你打印社保缴费凭证，然后去到东莞工作，可以在东莞参保，为了医保的连接性，最好是一停保后马上续保。以后可以将社保迁移到一个地方计算累计缴费年限。
法律依据：《中华人民共和国社会保险法》
第四条 中华人民共和国境内的用人单位和个人依法缴纳社会保险费，有权查询缴费记录、个人权益记录，要求社会保险经办机构提供社会保险咨询等相关服务。
个人依法享受社会保险待遇，有权监督本单位为其缴费情况。
第五十八条 用人单位应当自用工之日起三十日内为其职工向社会保险经办机构申请办理社会保险登记。未办理社会保险登记的，由社会保险经办机构核定其应当缴纳的社会保险费。
自愿参加社会保险的无雇工的个体工商户、未在用人单位参加社会保险的非全日制从业人员以及其他灵活就业人员，应当向社会保险经办机构申请办理社会保险登记。
国家建立全国统一的个人社会保障号码。个人社会保障号码为公民身份号码。
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