档案一般还是继续放在学校里的，延期毕业的学生，在取得毕业资格一年内，务必申请纳入毕业当年就业方案派遣，超过一年内不提交申请的，不再受理。因此在取得毕业资格一年内，到学校申请办理派遣手续。
法律依据：
《中华人民共和国档案法》
第十四条 应当归档的材料，按照国家有关规定定期向本单位档案机构或者档案工作人员移交，集中管理，任何个人不得拒绝归档或者据为己有。
国家规定不得归档的材料，禁止擅自归档。
第十六条 机关、团体、企业事业单位和其他组织发生机构变动或者撤销、合并等情形时，应当按照规定向有关单位或者档案馆移交档案。
第二十一条 鉴定档案保存价值的原则、保管期限的标准以及销毁档案的程序和办法，由国家档案主管部门制定。
禁止篡改、损毁、伪造档案。禁止擅自销毁档案。