细胞脂肪酸组成分析
Sherlock Microbial Identification System(MIS)就是一套由美国MIDI公司开发成功的微生物鉴定自动化系统，该系统操作安全、简单、快速，实验成本也相对较低。它主要根据不同种类微生物细胞膜中磷脂脂肪酸(Phospholipid fatty acid，PLFA)的类型和含量具有种的特异性、指示性和遗传稳定性等特殊性能对微生物进行全自动鉴定和分析，该系统备有图谱识别软件和迄今为止微生物鉴定系统中最大的数据库资源，包括嗜氧菌1 100余种，厌氧菌800余种，酵母菌和放线菌约300种，共计超过2 200种。
一、仪器设备
安捷伦6 890N气相色谱、Sherlock MIS系统、旋转式混合振荡仪、水浴锅、XW．80A旋涡混合器、10 IIll带聚四氟乙烯塞的玻璃瓶等。所有的玻璃器皿均需在马福炉中400~C烘烤1 h。
二、培养基
MIDI推荐培养基--TSBA培养基：加热混合溶解30 g胰蛋白胨大豆肉汤(Tryptiease soy broth，TSB)、15 g琼脂(Granulated ar)和1 L去离子水制成。
三、配置试剂 （所有有机试剂均为HPLC级，无机试剂均为优级纯）
溶液I（皂化试剂）：混合150 ml水和150 ml甲醇，加入45 g NaOH，同时搅拌至完全溶解。
溶液II（甲基化试剂）：325 ml 6 mol L 的盐酸加入到275 ml甲醇中，混合均匀。
溶液III（萃取试剂）：加200 ml甲基叔丁基醚到200 ml正己烷中，混合均匀。
溶液IV（碱洗液）：在900 ml去离子水中加入10.8 gNaOH，搅拌至完全溶解。
溶液V（饱和NaC1溶液）：在100 ml去离子水中加入40 g NaC1。
四、实验方法
试验方法主要参照MIDI操作手册，即在培养基上28℃恒温培养细菌24 h后取菌，通过提取和分离细菌细胞膜中的磷脂脂肪酸(PLFA)，甲基化后进行气相色谱鉴定分析。具体如下：
1 细菌的培养 在含TSBA培养基的培养皿和含牛肉膏蛋白胨培养基的培养皿上按照四区划线法分别接种4~C保存的菌株，28℃恒温培养箱中培养24 h。随机选取部分TSBA培养基上培养的菌株，转接到另一含TSBA培养基的培养皿中，28℃再培养24 h，用于比较活化处理时间长短对鉴定结果的影响。
2 菌株的获取 按照MIDI推荐的方法，三区取样获取的菌株脂肪酸最具代表性。因此用普通接种环获取已培养好的三区菌株至少40 mg到10ml带聚四氟乙烯塞的玻璃瓶中。
3 皂化 在取好菌株样的玻璃瓶中加入1.0 ml的溶液（I皂化试剂），盖好盖子，旋涡振荡5～10 S，于100℃的沸水浴中加热5 min，稍冷却后振荡5～10 s，再将玻璃瓶放入水浴中继续加热25 min，然后冷却至室温。
4 甲基化 每个玻璃瓶中加入溶液II（甲基化试剂）2.0 ml，盖紧盖子旋涡振荡后，放入80℃ 水浴加热10 min，再将玻璃瓶冷却至室温。
5 萃取 往玻璃瓶中加入1.25 ml溶液III（萃取试剂），玻璃瓶盖紧盖子在旋转式}昆合振荡仪上温和振荡10 min后，打开盖子，取出每个样品的下层相并丢弃，保留上层有机相。
6 基本洗涤 每个玻璃瓶中加入3.0溶液IV（碱洗液），盖紧盖子后在旋转式混合振荡仪上温和旋转振荡5 min。静置几分钟，若两相界面不清楚，加数滴溶液 V（饱和NaC1溶液）使两层液面的接口更清楚。
7 分析 吸取上层有机相于气相色谱样品瓶中，在安捷伦6890气相色谱仪，配备分流/不分流进样口，氢火焰离子化检测器（FID）及HP气相色谱化学工作站（HP CHEMSTATION ver A 5.01）；色谱柱为Ultra-2柱，
长25m，内径0.2mm，液膜厚度0.33?m；气相色谱各参数由MIDI Sherlock程序(MIDI，Inc．Newark，DE)设置调用（炉温为二阶程序升温：起始温度170 ℃，每分钟5 ℃升至260 ℃，随后以40 ℃/ min升至310℃，维持1.5min；进样口温度250℃， 载气为氢气，流速0.5ml/min，分流进样模式，分流比100:1，进样量2?l；检测器温度300℃，氢气流速30 ml/min，空气流速216ml/min，补充气（氮气）流速30ml/min。）
五、注意事项结果
MIDI操作手册指明，当鉴定结果第一选择的相似指数(Similarity Index，SI)在0．500以上，且第一选择和第二选择的sI差值大于0.100，则可以认为鉴定成功，鉴定结果为第一选择所列的菌种名。若sI值在0.300到0.500之间，且第一选择和第二选择的sI差值大于0.100，则表明第一选择与第二选择分开，鉴定可能成功，但是第一选择所列的菌种为非典型的菌株。当sI值小于0．300时，则认为该菌株不存在于数据库中，但软件会给出一个最相关的菌株。
不同培养基对细菌鉴定结果有明显的影响。这可能与MIDISherlock系统中微生物数据库是创建于指定培养基培养的微生物直接有关，其他培养基的化学成分不同于TSBA培养基，它含其他外源的磷脂以成分，这些成分会引起脂肪酸的描绘定量上出现偏移而干扰菌种鉴定中脂肪酸图谱分析，影响鉴定结果。因此，建议利用MIDI Sherlock系统鉴定细菌时应选用TSBA培养基培养细菌。
因篇幅问题不能全部显示，请点此查看更多更全内容