根据法律规定，在宅基地确权的时候，一般院子的面积与房屋的确权并不是一种所有权关系，只要院子的面积超不过建筑的面积，是可以进行确权的，以测量的面积为准。
法律依据
《农村宅基地管理办法》第十一条 宅基地面积计算:
(一)建筑物和构筑物以墙外包为界，接拼的以墙中或柱中为界;
(二)挑出的阳台和楼梯等以突出部分垂直投影计算占地面积，但底层不得构筑;
(三)由二户或二户以上使用同一宗土地的，用地面积按房屋产权的建筑面积与总面积的比例分摊;弄堂用地，使用 楼上的农户分摊面积为一半，其余为共用面积;
(四)通过购买商品房和以公开有偿出让方式取得国有土地使用权或集体土地有偿流转取得的集体土地使用权不计入宅基地面积。
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