个税申报并且已经扣款能更正申报。如果个人所得税申报扣款后发现有误，可以进入自然人扣缴客户端，首页选择要更正的月份进入，点击综合所得申报，工资薪金申报，选择更正申报，然后录入正确的申报数据。
《中华人民共和国税收征收管理法》
第五十一条
纳税人超过应纳税额缴纳的税款，税务机关发现后应当立即退还；
纳税人自结算缴纳税款之日起三年内发现的，可以向税务机关要求退还多缴的税款并加算银行同期存款利息，税务机关及时查实后应当立即退还；
涉及从国库中退库的，依照法律、行政法规有关国库管理的规定退还。
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