结婚后如果发现儿子不是自己亲生的，可以申请做亲子鉴定将其作为证据，然后再可以向法院提出离婚诉讼，并且提出附带民事赔偿的要求，要求法院判决离婚，同时提出由女方赔偿男方对于孩子的抚养费用，精神损失费用，以及生活费等。
【法律分析】
结婚后发现儿子不是亲生的，首先第一件事是做亲子鉴定。亲子鉴定，是运用生物学、遗传学等以及有关学科的理论和技术，根据遗传性状在子代和亲代之间的遗传规律，判断被控的父母和子女之间是否亲生关系的一种鉴定。如果鉴定结果不具有血缘关系，根据相关法律的规定，在夫妻关系存续期间，如果一方与他人通奸生育子女，隐瞒真情，另一方受骗而抚养了非亲生子女，受骗方支出的抚养费用应予返还。可以向法院起诉，要求返还抚养费。配偶权是指夫妻之间互为配偶的基本身份权。配偶权的性质是绝对权，其他任何人都负有不得伤害配偶权的义务。在现实生活，配偶一方如果侵害另一方的配偶权，主要表现为对义务的违反。离婚时，可以要求无过错方请求损害赔偿。
【法律依据】
《中华人民共和国民法典》
第一千零五十四条 无效的或者被撤销的婚姻自始没有法律约束力，当事人不具有夫妻的权利和义务。同居期间所得的财产，由当事人协议处理；协议不成的，由人民法院根据照顾无过错方的原则判决。对重婚导致的无效婚姻的财产处理，不得侵害合法婚姻当事人的财产权益。当事人所生的子女，适用本法关于父母子女的规定。婚姻无效或者被撤销的，无过错方有权请求损害赔偿。
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第一千零五十八条 夫妻双方平等享有对未成年子女抚养、教育和保护的权利，共同承担对未成年子女抚养、教育和保护的义务。
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