公司败诉的，对公司是有影响的，公司需要按法院判决书的要求执行判决。不履行判决书，不及时履行判决书，都将进入司法黑名单，影响征信。
诉讼费用由败诉方负担，胜诉方自愿承担的除外。部分胜诉、部分败诉的，法院根据案件的具体情况决定当事人各自负担的诉讼费用数额。
共同诉讼当事人败诉的，法院根据其对诉讼标的的利害关系，决定当事人各自负担的诉讼费用数额。
一、合同纠纷找哪个部门调解
1、行政调解，是指根据一方或双方当事人的申请，当事人双方在其上级业务主管部门主持下，通过说服教育，自愿达成协议．从而解决纠纷的一种方式。这种解决方式中，调解的部门是双方当事人的上级业务主管部门。
2、仲裁调解，仲裁是指合同当事人在发生纠纷时，依照合同中的仲裁条款或者事先达成的仲裁协议，向仲裁机构提出申请，在仲裁机构主持下，根据自愿协商，互谅互让的原则，解决纠纷的方式。这种解决方式中，调解的部门是仲裁机构。
3、法院调解，又称为诉讼中的调解，是指在人民法院的主持下，双方当事人平等协商，达成协议，经人民法院认可后，终结诉讼程序的活动。合同纠纷起诉到人民法院之后，在审理中，法院首先要进行调解。用调解的方式解决合同纠纷，是人民法院处理合同纠纷的重要方法。所以，这种方式中的调解部门是法院。
二、合同纠纷去哪里仲裁
1、平等主体的公民、法人和其他组织之间发生的合同纠纷和其他财产权益纠纷，可以到直辖市和省、自治区人民政府所在地的市仲裁机构或根据需要在其他设区的市仲裁机构申请仲裁。
2、用人单位与劳动者发生的因订立、履行、变更、解除和终止劳动合同的争议，可以到省、自治区人民政府决定的在市、县设立劳动争议仲裁委员会。
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