含有违法条款的协议一般有效，但其中的违法条款无效。双方可以协商更改违法条款，协商不能达成一致的可以依法请求人民法院或者仲裁机构确认违法条款无效。
【本文关联的相关法律依据】
《民法典》第一百五十六条
民事法律行为部分无效，不影响其他部分效力的，其他部分仍然有效。
第一百五十七条
民事法律行为无效、被撤销或者确定不发生效力后，行为人因该行为取得的财产，应当予以返还；不能返还或者没有必要返还的，应当折价补偿。有过错的一方应当赔偿对方由此所受到的损失；各方都有过错的，应当各自承担相应的责任。法律另有规定的，依照其规定。
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