逃离部队罪立案标准是这样规定的：
1、逃离部队持续时间达三个月以上或者三次以上或者累计时间达六个月以上的；
2、担负重要职责的人员逃离部队的；
3、策动三人以上或者胁迫他人逃离部队的；
4、在执行重大任务期间逃离部队的；
5、携带武器装备逃离部队的；
6、有其他情节严重行为的。
法律依据：
《军人违反职责罪案件立案标准的规定》第十八条
逃离部队罪是指违反兵役法规，逃离部队，情节严重的行为。
违反兵役法规，是指违反国防法、兵役法和军队条令条例以及其他有关兵役方面的法律规定。
逃离部队，是指擅自离开部队或者经批准外出逾期拒不归队。
涉嫌下列情形之一的，应予立案：
(一)逃离部队持续时间达三个月以上或者三次以上或者累计时间达六个月以上的；
(二)担负重要职责的人员逃离部队的；
(三)策动三人以上或者胁迫他人逃离部队的；
(四)在执行重大任务期间逃离部队的；
(五)携带武器装备逃离部队的；
(六)有其他情节严重行为的。
一、逃离部队罪与擅离军事职守罪的界限
这两种犯罪都有擅自离职的表现。其主要区别除了前者是故意犯罪，后者是过失犯罪外，逃离部队罪的犯罪主体是所有现役军人，其行为所违反的是现役军人依法服兵役的职责要求，行为人必须已离开部队；客观上并不要求已造成严重后果，而擅离军事职守罪的犯罪主体限定为指挥人员和值班、值勤人员，其行为发生在担任指挥和值班、值勤任务时，所违反的是指挥和值班、值勤人员的特殊职责要求，行为人只需离开特定的岗位，不要求必须离开部队，必须已造成严重后果。
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