法律分析：征地补偿协议应当明确土地所有权的变更，但法律并未规定具体的明确方式。根据相关法律规定，可以通过以下方式明确土地所有权的变更：
法律依据：
1.《中华人民共和国物权法》第二十二条规定：“土地使用权转让的，不得妨碍他人的所有权。”说明土地使用权转让时，应当明确土地所有权的变更。
2.《中华人民共和国土地管理法》第二十六条规定：“国有土地可以依法征收，补偿被征收人的合法权益。”说明在征地补偿协议中，应当明确土地所有权的变更。
3.《中华人民共和国城市房地产管理法》第十五条规定：“土地使用权转让的，应当在合同中明确土地权属和使用方式。”说明在土地使用权转让协议中，应当明确土地所有权的变更。
因此，在征地补偿协议中明确土地所有权的变更，可以通过在协议中明确土地权属、签订土地使用权转让协议等方式来实现。
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