在与政府部门沟通时，企业可以采取以下几种方法来减轻负担性行政决定对企业的影响：
建立良好关系：与政府部门建立长期稳定的合作关系，可以增加信任度，减少不必要的摩擦。
明确诉求：在沟通过程中，明确表达企业的诉求和需求，让政府部门更清楚地了解企业的立场和困难，有助于达成双赢的解决方案。
提供数据支持：通过提供客观的数据和信息，帮助政府部门更好地理解问题的本质和影响，从而更有针对性地制定政策和措施。
参与政策制定：积极参与政府部门的政策制定过程，提前介入，为企业争取更多的利益和权益。
寻求第三方帮助：如果企业与政府部门之间存在矛盾难以解决，可以寻求第三方中介机构或专业服务机构的帮助，协助双方达成共识。
案例：某企业在政府部门出台新的环保法规后，面临成本增加、生产受限等问题。企业通过与环保部门沟通，提供了自身的实际情况和困难，并提出了合理的建议。经过多次沟通和协商，政府部门对该企业给予了一定的优惠政策和支持，减轻了企业的负担，同时也保障了环保政策的实施。